Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC97Q96F63 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC97Q96F63 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms