Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC10A4Q96EP9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC10A4Q96EP9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC10A4Q96EP9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms