Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
L3HYPDHQ96EM0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
L3HYPDHQ96EM0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms