Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ERP27Q96DN0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ERP27Q96DN0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms