Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RUNDC1Q96C34 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RUNDC1Q96C34 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RUNDC1Q96C34 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 875.2 ms