Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMIGD2Q96BF3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMIGD2Q96BF3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMIGD2Q96BF3 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms