Protein–RNA interactions for Protein: Q96AQ1

CCDC74A, Coiled-coil domain-containing protein 74A, humanhuman

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Length 378 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74AQ96AQ1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC74AQ96AQ1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC74AQ96AQ1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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