Protein–RNA interactions for Protein: Q969S2

NEIL2, Endonuclease 8-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL2Q969S2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL2Q969S2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEIL2Q969S2 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEIL2Q969S2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms