Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NKD2Q969F2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKD2Q969F2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms