Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EDAQ92838 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EDAQ92838 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDAQ92838 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDAQ92838 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDAQ92838 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDAQ92838 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDAQ92838 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDAQ92838 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDAQ92838 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDAQ92838 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EDAQ92838 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EDAQ92838 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EDAQ92838 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDAQ92838 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDAQ92838 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDAQ92838 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDAQ92838 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDAQ92838 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDAQ92838 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDAQ92838 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDAQ92838 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDAQ92838 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDAQ92838 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EDAQ92838 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EDAQ92838 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EDAQ92838 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDAQ92838 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EDAQ92838 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms