Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC38.22■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC38.2■■■■□ 3.71
TRIM41Q8WV44 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.7
TRIM41Q8WV44 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
TRIM41Q8WV44 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms