Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBN0

RAB3IL1, Guanine nucleotide exchange factor for Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IL1Q8TBN0 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB3IL1Q8TBN0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB3IL1Q8TBN0 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms