Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TTLL11Q8NHH1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TTLL11Q8NHH1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TTLL11Q8NHH1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms