Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ8

CADM4, Cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM4Q8NFZ8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CADM4Q8NFZ8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADM4Q8NFZ8 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CADM4Q8NFZ8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CADM4Q8NFZ8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CADM4Q8NFZ8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms