Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCDC197Q8NCU1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC197Q8NCU1 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC197Q8NCU1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms