Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBK3

SUMF1, Sulfatase-modifying factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMF1Q8NBK3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SUMF1Q8NBK3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SUMF1Q8NBK3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms