Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB37

GATD1, Glutamine amidotransferase-like class 1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATD1Q8NB37 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GATD1Q8NB37 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GATD1Q8NB37 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms