Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ATG16L2Q8NAA4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms