Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIML1Q8N9V2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRIML1Q8N9V2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIML1Q8N9V2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms