Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9N7

LRRC57, Leucine-rich repeat-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC57Q8N9N7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRRC57Q8N9N7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRC57Q8N9N7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms