Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC89Q8N998 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCDC89Q8N998 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms