Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SVOPQ8N4V2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SVOPQ8N4V2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms