Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NME8Q8N427 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NME8Q8N427 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NME8Q8N427 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms