Protein–RNA interactions for Protein: Q8N309

LRRC43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC43Q8N309 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC43Q8N309 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC43Q8N309 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms