Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYR2

SMYD4, SET and MYND domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD4Q8IYR2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMYD4Q8IYR2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMYD4Q8IYR2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms