Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLF2Q8IX21 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLF2Q8IX21 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLF2Q8IX21 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms