Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCDC117Q8IWD4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CCDC117Q8IWD4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCDC117Q8IWD4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms