Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF13Q86YI8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF13Q86YI8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF13Q86YI8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF13Q86YI8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF13Q86YI8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF13Q86YI8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF13Q86YI8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PHF13Q86YI8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF13Q86YI8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF13Q86YI8 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF13Q86YI8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
PHF13Q86YI8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PHF13Q86YI8 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PHF13Q86YI8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms