Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIBP1Q86W92 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPFIBP1Q86W92 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms