Protein–RNA interactions for Protein: Q86UD4

ZNF329, Zinc finger protein 329, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF329Q86UD4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZNF329Q86UD4 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ZNF329Q86UD4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms