Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMC4Q7Z404 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TMC4Q7Z404 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMC4Q7Z404 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms