Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8C5

SYT13, Synaptotagmin-13, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT13Q7L8C5 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYT13Q7L8C5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT13Q7L8C5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms