Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ1

USP49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, humanhuman

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Length 688 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP49Q70CQ1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
USP49Q70CQ1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
USP49Q70CQ1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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