Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SYDE1Q6ZW31 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYDE1Q6ZW31 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYDE1Q6ZW31 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms