Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNB6

NFXL1, NF-X1-type zinc finger protein NFXL1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFXL1Q6ZNB6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NFXL1Q6ZNB6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFXL1Q6ZNB6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms