Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMC5Q6UXY8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMC5Q6UXY8 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms