Protein–RNA interactions for Protein: Q6SPF0

SAMD1, Atherin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD1Q6SPF0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 Metazoa_SRP.67-201ENST00000617099 296 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SAMD1Q6SPF0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SAMD1Q6SPF0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SAMD1Q6SPF0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms