Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TXNDC11Q6PKC3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TXNDC11Q6PKC3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms