Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NANOGP8Q6NSW7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms