Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SDE2Q6IQ49 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDE2Q6IQ49 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms