Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GGNBP1Q5YKI7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
GGNBP1Q5YKI7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms