Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYJ5

MALRD1, MAM and LDL-receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALRD1Q5VYJ5 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
MALRD1Q5VYJ5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MALRD1Q5VYJ5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms