Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTH9

WDR78, WD repeat-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR78Q5VTH9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
WDR78Q5VTH9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
WDR78Q5VTH9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
WDR78Q5VTH9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms