Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1orf220Q5T0J3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1orf220Q5T0J3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C1orf220Q5T0J3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms