Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NHSL1Q5SYE7 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
NHSL1Q5SYE7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NHSL1Q5SYE7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms