Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF678Q5SXM1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF678Q5SXM1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ZNF678Q5SXM1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF678Q5SXM1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF678Q5SXM1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms