Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HP1BP3Q5SSJ5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HP1BP3Q5SSJ5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms