Protein–RNA interactions for Protein: Q58A45

PAN3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit PAN3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAN3Q58A45 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PAN3Q58A45 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PAN3Q58A45 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms