Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TDRD12Q587J7 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TDRD12Q587J7 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms