Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA2Q53GA4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PHLDA2Q53GA4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms